Feliz 2015

DNA recognition by TAL effectors is mediated by tandem repeats, each 33 to 35 residues in length, that specify nucleotides via unique repeat-variable diresidues (RVDs). Each repeat forms a left-handed, two-helix bundle that presents an RVD-containing loop to the DNA. The repeats self-associate to form a right-handed superhelix wrapped around the DNA major groove. The first RVD residue forms a stabilizing contact with the protein backbone, while the second makes a base-specific contact to the DNA sense strand. Two degenerate amino-terminal repeats also interact with the DNA. Containing several RVDs and noncanonical associations, the structure illustrates the basis of TAL effector-DNA recognition.

DNA recognition by TAL effectors is mediated by tandem repeats, each 33 to 35 residues in length, that specify nucleotides via unique repeat-variable diresidues (RVDs). Each repeat forms a left-handed, two-helix bundle that presents an RVD-containing loop to the DNA. The repeats self-associate to form a right-handed superhelix wrapped around the DNA major groove. The first RVD residue forms a stabilizing contact with the protein backbone, while the second makes a base-specific contact to the DNA sense strand. Two degenerate amino-terminal repeats also interact with the DNA. Containing several RVDs and noncanonical associations, the structure illustrates the basis of TAL effector-DNA recognition.

Las proteínas crean formas únicas y un ejemplo de ello son los llamados TAL effectors, que forman una especie de girnalda que se une al surco mayor del ADN y envuelve su secuencia de forma selectiva. Estas pequeñas maravillas que eran desconocidas hasta hace pocos años se encuentran en bacterias que atacan plantas. La girnalda está compuesta por repeticiones en tandem que al parecer reconocen bases específicas del ADN, esto abre múltiples posibilidades en biotecnología y quizá se conviertan en un herramienta importante en los laboratorios de biología molecular.

Con esta bella proteína os deseamos un Feliz año 2015, pasado ya este 2014 año de la cristalografía.

REFERENCIAS

The Crystal Structure of TAL Effector PthXo1 Bound to Its DNA Target. Amanda Nga-Sze Mak, Philip Bradley, Raul A. Cernadas, Adam J. Bogdanove, Barry L. Stoddard. Science 10 February 2012: Vol. 335 no. 6069 pp. 716-719 DOI: 10.1126/science.1216211

Anuncios

Responder

Introduce tus datos o haz clic en un icono para iniciar sesión:

Logo de WordPress.com

Estás comentando usando tu cuenta de WordPress.com. Cerrar sesión / Cambiar )

Imagen de Twitter

Estás comentando usando tu cuenta de Twitter. Cerrar sesión / Cambiar )

Foto de Facebook

Estás comentando usando tu cuenta de Facebook. Cerrar sesión / Cambiar )

Google+ photo

Estás comentando usando tu cuenta de Google+. Cerrar sesión / Cambiar )

Conectando a %s